HabibMuhammad bin Idrus Al-Habsyi wafat pada pertengahan malam, hari rabu, 12 Rabiul Tsani 1337 H, di Kota Surabaya. Jasad beliau di makamkan dalam Qubbha di pemakaman Al-Habib Hasan Al-Habsyi di kawasan Masjid Ampel Surabaya, pada hari Rabu waktu Ashar.
3 Alwi, keturunannya disebut AI-Ahmad bin Zain dianurulya datuk waliyyullah A!-Habib Muhammad bin Idrus AI-Habsy, yang makamnya di Ampel Gubbah Surabaya. 4. Husein, salah satu anak cucunya adalah waliyyullah AI-Habib Alwi bin Ali bin Muhammad Al-Habsyi, makamnya berada di Mesjid "Al-Riyad" di kota Solo (Surakarta) 5. Idrus. 6. Hasyim. 7 Konstruksibangunan aktifitas santri semuanya harus mengarah kepada tujuan ili. Disinilah arti penting aktivitas santri dan sistem bangunannya, karena hal inilah yang akan membentuk kepribadian dan prilaku santri ketika ia kembali ke tengah - tengah masyarakat. Al-Hamdulillah, hal ini sudah menjadi perhatian di PP. Langitan. TausiahHabib Umar Al-Muthohhar: Para Masyayikh itu Shalih sekaligus Muslih Tausiyah Habib Ubaidillah bin Idrus Al-Habsyi; Siapa Orang yang Sukses Dunia? Panitia Siapkan Ribuan Nampan Konsumsi Haul Akbar PendudukTarim dan yang lainnya menyambutnya karena mereka melihat tanda kebaikan pada dirinya. Habib Ali juga menuntut ilmu dari ulama di zamannya, seperti Habib Ahmad bin Muhammad Al-Muhdhar, imam para sayyid yang mulia, Habib Ahmad bin Abdullah bin Idrus Al-Bar, Imam Idrus bin Umar bin Idrus Al-Habsyi, dan yang lainnya). .